9 月17至18日，2011賽季MotoGP來到了西班牙的阿拉貢賽道。兩周前雅馬哈車手洛倫佐在米薩諾的勝利在很大程度上保留了本賽季冠軍歸屬的懸念。斯托納損失的9個積分還不是本田車隊最為擔心的，澳洲人的健康問題恐怕才是目前最為關鍵的。據斯托納在米薩諾站賽后透露，在比賽的開始階段，雖然一度身處洛倫佐身后，但是他對于賽車以及輪胎的感覺非常好，他當時認為并沒有必要急于將自己推向極限。但是很快，他就突然感覺身體十分疲勞，失去了追趕前車的機會。斯托納的身體問題由來已久，2009賽季的時候他就曾因為胃病而早早失去了爭冠的機會。在今年奪冠形勢一片大好的情況下，他的身體再次亮起了紅燈，正所謂傷病猛于虎，相比于洛倫佐，恐怕這才是澳洲人奪得個人職業生涯第2冠的最大阻礙。
新涂裝本田
在縮小了與領頭羊斯托納的積分差距后，雅馬哈車隊再次于近日收獲了一個好消息——隊中兩名車手洛倫佐和史畢斯已經決定將會參加10月在日本舉行的茂木站。根據原計劃，雅馬哈將會在茂木站期間舉行參加MotoGP50周年的一系列慶典活動，如果洛倫佐和史畢斯無法到場的話，那將是最大的遺憾。洛倫佐的參賽無疑在本田車隊產生了多米諾骨牌效應，相信在當前緊張的爭冠形勢下，斯托納必然不會眼看著洛倫佐單獨前往日本獨攬25個積分。除了爭冠軍團的車手，之前態度強硬表示不會前往日本的杜卡迪車手羅西也在阿拉貢站之前宣布自己將會前往日本參賽。在被問到為何改變之前的立場時，羅西表示，從目前的情況來看，茂木賽道已經足夠安全，所以他沒有不去的理由。
在沒有成績壓力的情況下，羅西顯然將2011賽季看成了下個賽季的鋪墊。在阿拉貢站，羅西將放棄碳纖維車架，改而使用鋁合金車架，他希望這個改變能夠幫助他挽回一些時間。遙想到去年斯托納就是因為對碳纖維車架的不適應(編者注：斯托納曾表示，賽車前輪總會莫名其妙地突然失去抓地力)才導致早早失去了爭冠的機會，而今年羅西也在車架的選擇上苦不堪言，杜卡迪想要在2012重回爭冠行列，要做的功課還有很多。更讓這支意大利車隊感到無奈的是，阿拉貢賽道在周五出現電力問題，第2次自由練習不得不取消。羅西也無奈地表示，練習時間的減少對于他們來說是個巨大的損失。在周六的排位賽中，斯托納發揮神勇，摘得了個人賽季第9個桿位，他的隊友佩德羅薩第2，雅馬哈車手史畢斯第3，洛倫佐只排名第4。賽后，衛冕冠軍表示，想要在阿拉貢奪冠是幾乎不可能的。羅西在杜卡迪再次遭受職業生涯冰點，原本第13的排位成績就已經夠他郁悶的了，而賽后他又宣布臨時更換賽車引擎，被罰決賽從維修區發車，真是屋漏偏逢連夜雨啊。
決賽發車后，雖然雅馬哈車手史畢斯一度攀升至頭名，但是賽車性能方面的差距讓他很快將領先位置交還給本田的斯托納和佩德羅薩。洛倫佐苦于賽車調校無法向本田發起挑戰，只能守在第4的位置。幾圈之后，格萊斯尼車手西蒙切利逐漸跟上領先集團，并相繼超越了雅馬哈的洛倫佐和史畢斯，升至第3位。但是，一次駕駛失誤讓西蒙切利很快又將位置還給了雅馬哈雙星，維修區發車的羅西在比賽進行到一半時，就對后半區的一幫車手痛下殺手，排名升至第9。
比賽最后階段，洛倫佐逐漸找到感覺，在超越了自己的隊友后升至第3位。而史畢斯也沒有能夠守住第4的位置，他很快又被西蒙切利超越。最終，使用紀念版涂裝的斯托納率先撞線，輕松奪得賽季第8冠，佩德羅薩第2，洛倫佐第3，羅西最后關頭被克勞奇諾超越只收獲第10，埃里亞斯與卡比羅西發生撞車雙雙退賽。本站比賽結束之后，斯托納進一步擴大自己的領先優勢，衛冕冠軍洛倫佐已經落后他有44分之巨，年度冠軍的懸念已經越來越小。