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吉林大學錢虎軍教授課題組 JACS Au:在化學特異性精準高分子粗粒化方法發展方面取得新進展
2024-03-18  來源:高分子科技

  分子動力學模擬是高分子學科中研究構效關系的重要手段,是銜接實驗和理論的重要橋梁。然而,傳統全原子分子動力學模擬技術由于所能模擬的空間及時間尺度相對有限,很難滿足實際需求。粗粒化模擬技術是提升效率的主要途徑。但由于粗粒化過程中自由度的約化,缺乏對C-H鍵等底層微觀化學細節的有效考慮,所獲得的多尺度結構及動力學等性質與實驗或全原子模擬相比偏差較大,只能做到半定量計算與預測,極大地限制了分子動力學模擬在解釋實驗新現象、助力新材料研發等方面的潛能。因此,亟需發展化學特異性精準粗粒化模擬方法,在約化體系自由度的同時,有效考慮C-H鍵等被約化自由度對體系各類性質的影響,實現高分子體系不同時空尺度結構及動力學性質的準確定量描述,這也是目前高分子理論模擬領域面臨的挑戰性難題及重要國際前沿方向。


基于廣義朗之萬方程的高分子粗粒化模型


  高分子因其獨特的長鏈特征,具有熵效應強、體系復雜、勢能面維度高、模擬所需時間長等特點。而在共聚及高分子納米復合等多組分體系中,由于界面的存在,體系變得更加復雜,呈現出典型的多組分、多尺度、強關聯特征。全原子模擬雖日趨成熟,但是對于長鏈高分子的松弛動力學、復合體系中的界面結構及動力學、以及納米粒子的長時間擴散等問題,很難利用全原子模型進行有效模擬。為了提高計算效率,通過在空間及時間尺度上發展特定的投影算法,對模擬體系進行自由度約化(粗粒化)處理,是拓寬模擬的時間以及空間尺度,解決上述問題的必要途徑。過去幾十年中,雖然現有的模型(如使用Lennar-Jones作用勢的Kremer-Grest模型)在高分子領域取得了巨大成功,但是此類模型由于作用勢形式相對簡單,缺乏對C-H鍵振動等被約化自由度的有效考慮,獲得結果與全原子模型或實驗相比偏差較大。因此很難實現真實化學體系中多尺度結構及動力學性質,尤其是高分子體系特有的特征尺度關聯性等的定量描述,從而很難滿足針對特定體系特定性質的定量研究需求。盡管近些年來多種由底向上粗粒化方法發展日趨成熟,如迭代玻爾茲曼反演(iterative Boltzmann inversion)、力匹配(force matching)等方法已被成功用于構建結構一致性的粗粒化模型,但由于自由度的約化,這些模型中的動力學性質通常遠快于實驗或全原子模型。此外,高分子鏈內由重復單元間的分子連接性導致的各尺度間的動力學關聯使得高分子體系的動力學性質表現出典型的非馬爾可夫性,這使得在粗粒化模型中準確還原多尺度動力學性質極具挑戰。


圖2 粗粒化模型的動力學性質


  近期,吉林大學錢虎軍教授團隊基于能夠準確描述粒子間徑向分布函數的迭代玻爾茲曼反演方法與廣義郎之萬方程相結合,為了引入被約化掉的C-H鍵等化學細節對體系動力學性質的影響,利用含時記憶內核函數,以全原子模擬中獲得的速度自相關函數為紐帶,極大地優化了粗粒化模型中以均方位移、速度自相關函數、力自相關函數、應力松弛模量等為代表的動力學性質,獲得結果與全原子模擬一致。為了兼顧精準度與計算效率,該方法將復雜的長時間記憶內核拆解為一個馬爾可夫的Rouse摩擦系數,以及非馬爾可夫的短時間記憶內核,前者主導長時間的擴散行為,后者決定了局部的碰撞與亞擴散行為。同時,作者開發了一套系統化的優化流程,用于時間依賴的記憶內核的構建。該方法有望被推廣至更多的復雜聚合物體系,在粗粒化模型所能達到的介觀模擬尺度,針對特定體系,實現具有全原子模擬精度的化學特異性的多尺度結構及動力學性質的預測。


  該工作以“Chemically Specific Systematic Coarse-Grained Polymer Model with Both Consistently Structural and Dynamical Properties”為題發表在JACS Au上。吉林大學化學學院博士研究生張旭澤、助理教授施睿為文章共同第一作者,通訊作者為吉林大學化學學院教授錢虎軍,該研究得到了國家自然科學基金委的支持。


  全文鏈接:https://doi.org/10.1021/jacsau.3c00756

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