辦理的程序為：
·申請廠商對需進行認證的產品歸類、總結，確定需要認證的產品品種；
·填寫附件中的資料申報表格，進行Oeko-TexStandard100認證的資料申報；在收到要求的申報資料后，認證機構會幫助申請廠商審核資料，然后分別做出樣品指令和進行費用初步計算。
·由申請廠商進行Oeko-TexStandard100認證的測試樣品的準備工作；
·在收到樣品指令后，申請廠商應積極準備測試樣品，并填寫申請表格寄到TESTEX北京辦事處。
·在收到測試樣品后，認證方會核對資料和樣品，發出付款通知。款到測試開始。測試一般需要3-4個星期。合格后立即頒發證書，
·證書和測試報告會先傳真，然后郵寄給廠商。
·申請廠商授權使用Oeko-Texstandard100標簽。
而困擾國內廠商的一個問題就是，如果申請國內的機構認證是否可以和Oeko-Tex100互認(也就是兼容)？對于此關鍵問題，記者分別采訪了國家生態紡織品質量監督檢驗中心與TESTEX瑞士紡織檢定有限公司李明東先生，前者對記者的提問似乎興趣不大，一再推遲答復；后者則明確答復，兩個認證是不可以互認的。李明東先生補充說，“Oeko-Tex系列認證應該主要是服務于出口歐盟的，而國內的認證主要是服務于國內市場的。”由此看來，兩個認證的具有一定的區域適用性，基本上應該是井水不犯河水。
國內認證：當心山寨
針對于生態紡織品市場的走火，不少廠商求之不得，甚為苦惱。而一些民間的認證機構也心照不宣，推出了種種級別不同的認證方案。這種“山寨版”認證遭遇到了某些官方認證機構的怒斥，某監測機構負責人表示，“現有紡織服裝檢測機構除國家全額撥款的法定檢測機構外，其他多是硬件條件落后，缺乏研發能力，且測試結果一般不被國外買家認可，無法適應國際市場需求。”
2000年1月，國家環境保護總局批準并開始實施《生態紡織品》標準，表明國家對服飾影響人體健康的關注。2002年11月，國家又頒布實施了《生態紡織品技術要求》。該標準根據最終用途將生態紡織產品分為4類，即嬰幼兒用品、直接接觸皮膚用品、非直接接觸皮膚用品、裝飾用品。對有害物質分別規定了禁用或限量指標。2006年，國家又推出了一系列紡織品中有害物質檢測的國家標準方法，為生態紡織品的鑒定提供了科學依據。這些標準都是參照歐洲生態紡織品認證的要求，結合國內實際制定的，但還只是推廣執行而不是強制執行。
一些普通消費者對生態紡織品的國內標準混亂的局面表示，一方面，國家還要大力加強宣傳，要不然真不知道。另外一方面，比較實用的加強消費者教育，讓消費者學會鑒別，對假冒綠色能夠去打假，這樣才能真正形成中國的生態紡織品市場環境，從而為造富國民真正加分。