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DNA 雜交機(jī)理的粗粒化分子模擬研究 |
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| 資料類型： |
JPG圖片格式
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| 關(guān)鍵詞： |
DNA 雜交 分子模擬 拉鏈模型 |
| 資料大小： |
96K |
| 所屬學(xué)科： |
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| 來(lái)源： |
來(lái)源網(wǎng)絡(luò) |
| 簡(jiǎn)介： |
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DNA雜交機(jī)理是生物學(xué)領(lǐng)域一個(gè)廣受關(guān)注的基礎(chǔ)性問(wèn)題，其成核細(xì)節(jié)尚不為人所知。Ouldridge等最近開(kāi)發(fā)了一個(gè)新的粗粒化DNA模型—oxDNA，合理的擬合了DNA的氫鍵相互作用和堆疊相互作用，能夠同時(shí)表現(xiàn)DNA單鏈的柔性和雙鏈的剛性。到目前為止，該模型已經(jīng)成功的應(yīng)用于一系列的DNA結(jié)構(gòu)以及DNA納米器件的模擬，如DNA鑷子和DNA行走機(jī)器人。我們以該模型為基礎(chǔ)，通過(guò)引入贗動(dòng)力學(xué)（metadynamics）和過(guò)渡路徑采樣（transitionpathsampling）方法，研究了短鏈DNA的雜交機(jī)理和成核機(jī)理。研究結(jié)果表明，只有單一重復(fù)序列才采用“滑行式（slithering）”的雜交方式，不遵循特定的路徑；而對(duì)于一般隨機(jī)序列，其采用“拉鏈?zhǔn)剑▃ippering）”的雜交方式，有較為嚴(yán)格的形成路徑。 |
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| 上傳人： |
liu
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| 上傳時(shí)間： |
2013-11-14 16:41:36 |
| 下載次數(shù)： |
0 |
| 消耗積分： |
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