《南方科技大學管理暫行辦法》（摘要）
教授治學 學術自治
第五條 南科大堅持追求卓越、學術自由、學者自律的大學精神，遵循理事會治理、教授治學、學術自治的原則，培育和發揮大學應有的活力和創造力，實行黨委領導下的校長負責制，并按照本辦法和南科大章程對大學實施管理。
政府部門確定編制
第九條 南科大在市機構編制部門確定的編制標準范圍內確定人員總額；確因工作需要，需超過編制標準配備人員總額的，應當報市機構編制部門核定。
第十一條 南科大根據社會需求、辦學條件以及國家有關規定，制定招生方案，按照科學、公開、擇優的原則探索依法自主招生。
理事會為決策機構
第十五條 理事會由政府代表，南科大校長及管理團隊、教職工等代表和社會知名人士等組成。理事會設理事長和副理事長，理事長由深圳市市長或市長委任的人員擔任。理事由市政府聘任。
第十六條 理事會為南科大的決策機構，按照本辦法和章程的規定依法履行以下職責：
（一）根據本辦法規定聘任或解聘校長；
（二）根據校長提議聘任或解聘副校長；
（三）審定學校章程或章程修改草案；
（四）審定學校的財務預算和決算報告；
（五）審議批準學校中長期發展規劃、年度工作計劃、年度工作報告；
（六）審議批準學校人員總額以及人力資源管理等重要制度；
（七）審議批準學術單位和行政單位的設立、變更或撤銷；
（八）審議批準關系學校發展的其他重大事項。
前款第（三）項應當按規定報國家教育部批準，第（四）項應當報市政府按規定程序批準，第（二）、（五）、（六）、（七）項應當報市政府有關部門備案。
校長每屆任期五年
第二十條 校長每屆任期為五年，屆滿后經理事會同意可以連任；連任兩屆以上的，應當啟動遴選程序并經理事會按相關規定確定。
校長不稱職或不能履行職責的，經理事會三分之二以上成員同意提出免去其職務的建議，報市政府按規定程序決定。
第二十五條 校學術委員會負責對學校教學、科研等重大學術事項進行審議，具體履行以下職責：
（一）審議學校的學術發展規劃；
（二）審議學科、專業的設置方案，教學、科研計劃方案；
（三）審議教師、教輔人員的聘用、晉升及解聘事宜；
（四）組織評定教學、科學研究成果；
（五）審議其他學術事項。
